2000 - 2008
创建世界一流大学是北京大学面向21世纪提出的宏伟规划，是世纪之初指导北京大学各项建设的纲领。在国家“211工程”和“985工程”建设经费的支持下，北大以创建世界一流大学为目标，坚持“追求真理、追求卓越、培养人才、繁荣学术、服务人民、造福社会”“的理念，以学科发展为重点，以队伍建设为核心，以体制与机制创新为动力，全面推进理论创新、制度创新、科技创新和教育创新，进一步提高学科建设、科学研究、师资队伍、学校管理的水平，提高教育质量和办学效益，充分发挥培养高层次创新人才、发展文化科学技术、解决国家经济建设和社会发展重大问题的作用。
教学改革力度继续加强。于2001年启动“元培”本科教学改革计划；完成了由300多门全校通选课构成的新的课程体系建设；根据“以研究生教育为主导，本科教育为基础，构建研究型大学发展框架”的基本思路，稳步扩大研究生教育规模，同时，本着“确保质量，追求卓越”的理念，在招生、培养、学位授予、奖助等重要环节不断改革和完善机制，以保证和提高研究生、特别是博士生的培养质量。到2005年，北大拥有18.5个国家基础科学研究与教学人才培养基地。截至2007年11月，北大获国家级精品课程累计达到46门，位居全国高校首位；“十五”期间，获国家级教学成果特等奖2项（与兄弟院校合作1项）、一等奖11项。
坚持人才是第一资源的原则，建立了总量控制、按需设岗、公开招聘、平等竞争、择优聘用、分级流动、岗位管理的教师聘任和职务晋升制度，不断提高教师的教学科研水平和综合素质，增强教师队伍的竞争力，并狠抓师德建设，以适应创建世界一流大学的要求。经过“十五”建设，北京大学教师队伍的基本状况明显改善，有博士学位的人数已超过60％，教授平均年龄下降到50岁。截至2007年12月，北京大学拥有两院院士61人，国家杰出青年基金获得者128人，长江学者奖励计划入选者99人，国家973项目首席科学家19人。另外，25名人文社会科学领域的著名学者被评为文科资深教授。
以学科建设为核心，强化学科管理和机构调整。2000年4月，北京大学和北京医科大学合并组建新的北京大学，学校整体实力得到加强。此后，学校进行了较大幅度的院系结构调整。到2007年，北京大学共有5个学部，41个院系，81个重点学科。2002年至2004年，教育部对全国除军事学外的全部80个一级学科进行评估，北京大学参评的33个学科中，有11个学科名列全国第一，另有3个学科名列全国高校第一，其中数学、化学、历史学及外国语言文学4个学科获得5项指标全部满分的好成绩。
“十五”期间，北京大学获得1项国家最高科学技术奖，11项国家自然科学二等奖（一等奖空缺三届），8项国家科学技术进步二等奖。人文社会科学方面，在每两年一次的“北京市哲学社会科学优秀成果奖”和每三年一次的“全国高等学校人文社会科学研究优秀成果奖”评选中，北京大学获奖等次和获奖总数均位居榜首。2004年北京市第八届哲学社会科学优秀成果评奖中，北大获奖总数达34项。其中特等奖2项，占特等奖总数的50％；一等奖10项，占一等奖总数的28.57%；二等奖22项。“十五”期间，全校38篇论文被评为全国优秀博士论文。
通过“十五”“211工程”建设，北大建成了14c加速器质谱仪、时间飞行质谱仪、环境扫描电镜等高水平的大型公共测试仪器技术平台，这些设备具有国际先进水平，为北大以及全国相关科研人员开展世界水平的研究工作打下了良好基础。校园信息网络主干网完成更新改造，校园网的建设上了一个新的台阶。图书馆初步实现由传统图书馆向数字图书馆的转型，建成具有国际先进水平、学术型、开放式、数字化的大学图书馆系统。餐饮中心、新的学生宿舍楼等建筑相继建成投入使用，静园地热井成功开凿，后勤服务设施大大改善。学校的产业持续保持高速增长势头，产学研一体化向更高层次发展。在高校服务社会、服务经济建设的职能发挥上，进一步加大与国内各省市、部门的合作，已经与国内数省区、市和银行签订全面合作协议。国际合作蓬勃开展，与世界一流名校开展了形式多样的交流和合作。世纪之初的短短几年间，许多重要的外国元首和数十位诺贝尔奖得主访问北大并发表演讲，每年到访北大的外宾超过20000人次。北大每年出访交流的教员和学生超过5000人次。
北大党建及思想政治工作与时俱进，在坚持办学的社会主义方向的基础上，采取形式多样的工作方式，不断提高广大党员的党性修养，增强党组织的凝聚力和战斗力，保证党对学校的正确领导。北大校园文化丰富多彩，两百多个学生社团活跃在校园里，百周年纪念讲堂的各种演出和文化活动精彩纷呈，一年一度的全校运动会、一二九歌咏比赛、北大十佳歌手大赛、北大十佳教师评选等已经成为校园内的传统活动。
自1898年京师大学堂成立到2008年，北京大学走过了110年的历程。回溯既往，作为中国的最高学府，北京大学聚集了各个历史时期众多的著名学者专家、学术大师，涌现出大批革命家、思想家、理论家、科学家和教育家，培养了一代代优秀人才，创造了一批批重大的科学成果，深刻地影响了中国近现代科学技术、思想理论、文化教育和社会发展的进程。一个水平更高、实力更强、更加富有生机活力的北京大学必将在二十一世纪跻身世界一流大学之林，必将为中华民族的伟大复兴，为建设富足美好民主昌盛的社会主义现代化中国，为人类文明的发展进步作出更大贡献。